Dank äußerst guter Konditionen entschied sich Onur Air Ende 1995 für fünf 172-sitzige McDonnell Douglas MD-88 und vereinbarte Optionen für weitere fünf MD-88. Während alle fest bestellten MD-88 schneller als geplant ab Mai 1997 innerhalb einer kurzen Zeit zur Auslieferung kamen, so wurden die Optionen nicht mehr in Festbestellungen umgewandelt. Am 4. Mai 1997 sollen die ersten beiden MD-88 TC-ONM und TC-OMN eingetroffen sein, gefolgt von der TC-ONP am 8. Mai und der TC-ONR am 31. Mai und schließlich der fünften MD-88 am 25. Juni 1997. Die MD-88 ergänzen Airbus A321-100 und Airbus A300, ersetzten aber A320.

McDonnell Douglas war sehr glücklich darüber, dass sie in der Türkei die Onur Air für ihre MD-80 gewinnen konnte und McDonnell Douglas soll auch der Airline weitreichende Garantien in Bezug auf Wirtschaftlichkeit und Zuverlässigkeit und Ausbildung der Piloten gegeben haben. Onur Air bot zeitweise auch Linienflüge innerhalb der Türkei an, die aber aufgrund hoher Verluste wieder eingestellt wurden. Onur Air konzentrierte sich seitdem wieder auf ihre Charterdienste, vermietete von Zeit zu Zeit ihre Flugzeuge an andere Luftfahrtgesellschaften. So kamen MD-88 auch in den Farben der Air Anatolia zum Einsatz, während man die A321 auch zeitweise nach Pakistan vermitteln konnte und diversen arabischen Fluggesellschaften auch Kapazitäten während der Pilgersaison von Moslems zur Verfügung stellt. Im Januar/Februar 2003 wird gemeldet, dass Onur Air zwei A320 (wieder) anmietet.

Es sah nach einer eindeutigen Expansionsphase aus, denn die Fluggesellschaft baute in letzter Zeit ihre A300-Flotte um weitere Exemplare aus, darunter anscheinend auch mit A300-600 und/oder A300-600R. Anfang März 2003 kommt es zu einer unerwarteten Entwicklung. Eine der fünf  MD-88 von Onur Air wird in den Farben von Iberia gesichtet. Dabei handelt es sich um die McDonnell Douglas MD-88 mit der Registration TC-ONM „Yasemin“. Es handelt sich dabei um eine der ersten MD-88, die an Onur Air ausgeliefert wurden. Onur Air scheinen wohl die Vorzüge einer reinen A320/321-Flotte einfach so groß zu sein, dass der Einsatz von einer MD-88-Teiflotte von fünf Exemplaren mittelfristig keine gute Lösung darstellt. Onur Air plant, ab November 2003 wieder innertürkische Liniendienste anzubieten und es gab Gerüchte, dass sich Onur Air von ihren MD-88 trennen könnte.

Am 17.06.03 musste die Onur Air MD-88 TC-ONP in Groningen/Niederlande, einen Startabbruch einleiten. Dabei soll die MD-88 ca.50 m über die Startbahn hinausgeschossen sein. Es sollen sich 142 Passagiere sowie eine Crew von 8 Personen an Bord befunden haben. Es wurde eine Notevakuierung eingeleitet. Erfreulicherweise gab es nur wenige Verletzte, keine Toten und die MD-88 wurde repariert. Als Ursache für diesen schweren Zwischenfall wurde u.a. ermittelt, dass die Trimmung (basierend auf die tatsächliche Gewichtsverteilung der Nutzlast) nicht richtig eingestellt war und die Warnung hierfür ignoriert wurde.

Im Jahr 2005 erhält Onur Air u.a. die an Iberia vermietete MD-88 vorzeitig zurück. Im Hochsommer 2005 häufen sich medienträchtige Meldungen über die angebliche Flugunsicherheit bei Onur Air. Die Situation spitzte sich dramatisch zu, nachdem u.a. Deutschland, die Niederlande, die Schweiz und Frankreich der Onur Air die Einflugerlaubnis entzogen. Nach wenigen Wochen wurden diese Verbote aber "unter Auflagen" wieder aufgehoben.

Onur Air stellte ein neues Farbschema vor und dies kam recht zeitgleich mit der Meldung, dass die MD-88-Flotte um weitere vier MD-83 aus Beständen der Jetsgo ergänzt werden sollen und die MD-83/-88 primär für den Liniendienst eingesetzt werden sollen. Hierfür bieten die MD-80 ein Angebot von jeweils 165 Ledersitzen.

Mitte Mai 2007 wird bekannt, dass Onur Air 13 Flugzeuge bei Airbus bestellen möchte, darunter zehn A320/321. Zwar wird nicht erwähnt, dass die zusätzlichen A320/321 die neun MD-80 ersetzen werden, aber die Möglichkeit ist gegeben. Ausgeliefert werden sollen die A320/321 bis 2012.

Ende Juli 2007 wird bekannt, dass Onur Air eine MD-82 von der bestair angemietet hat, die zuvor bei der Alajnihah Airways im Einsatz stand. Somit setzt Onur Air zehn MD-80 ein. Ende 2007 wurde die angemietete MD-80 wieder retourniert.

Ende 2008 wird offiziell bekannt, dass Onur Air Käufer für ihre vier MD-83 sucht. Als Käufer konnte offiziellen Meldungen nach die Khors Air gewonnen werden, die aber diese Flugzeuge für andere Unternehmen einsetzen sollte.