Das JPATS transportiert illegale Ausländer sowie verurteilte Straftäter im Auftrag des Federal Bureau of Prisons mit Flugzeugen an ihre Zielorte. Hervorgegangen sind JPATS aus der National Prisoner Transportation System des U.S. Marshals Service.

JPATS wird allgemein als "regierungseigene Fluggesellschaft" bezeichnet.

Unter sehr strengen Sicherheitsstandards werden diese Gefangentransporte und Auslieferungsflüge durchgeführt. So besteht die Kabinenbesatzungen ausschließlich bewaffnete und uniformierte U.S. Marshal. Zur Flotte zählen auch farblich gänzlich neutral-weiss gehaltene McDonnell Douglas MD-80. Die Anzahl dieser Teilflotte wird verschiedenen Angaben nach mit vier bis sechs Flugzeugen angegeben.

Im Interesse einer hohen Sicherheit werden nur Basisinformationen vermittelt. Die Flüge bzw. deren Routen sind nicht bekannt, auch werden nur sehr spärliche Informationen über die verwendeten Flugzeuge erteilt.

JPATS hat in der Öffentlichkeit den viel bekannteren Spitznamen "Con Air".