Austral entstand durch die Fusion von Austral Compania Argentina de Transportes Aereos und Aerotransportes Litoral Argentino (ALA). Diese Entwicklung führte zu einer Flotte, die sich mehrheitlich aus BAC One-Eleven und NAMC YS-11 zusammensetzte. Austral tätigten im April 1979 eine Bestellung über fünf MD-81. Der geplante Einsatz von 155-sitzigen MD-80 sollten der Austral eine erhebliche Erweiterung ihrer Kapazitäten ermöglichen. Die sehr frühe Entscheidung zugunsten der MD-80 war in mehrfacher Hinsicht historisch bemerkenswert. Austral wurde somit der erste südamerikanische und argentinische Kunde für diesen Flugzeugtyp. Auch erscheint nicht unerheblich, dass Austral zuvor kein Kunde von McDonnell Douglas waren. Der Hersteller gewann somit nicht nur einen frühen Kunden, sondern auch einen Neukunden! 

Austral setzte für eine kurze Zeit auch zwei DC-9-50 ein, die direkt ab Werk von der Finnair zwischen Dezember 1978 bis November 1980 bis zur Auslieferung der MD-81 angemietet wurden. Diese Möglichkeit ergab sich durch die Verfügbarkeit von fabrikneuen DC-9, die Finnair nicht in Eigenregie wirtschaftlich einsetzen konnten. Der Einsatz von DC-9-51 ermöglichten der Austral rückblickend eine gewisse Eingewöhnungsphase mit dem Grundmuster DC-9 und eine gute Vorbereitung im Hinblick auf den geplanten Einsatz von MD-81.

Die erste McDonnell Douglas MD-81 wurde am 08.01.1981 an Austral ausgeliefert. Die jeweils 155-sitzigen MD-81 ergänzten damals und noch für bis Mitte der 1990er Jahre eine Flotte von BAC One-Eleven. Diese charakteristische Flottenstruktur war ein sehr vertrauter Anblick in Argentinien und durch die Tatsache auffällig, dass man mit der BAC One-Eleven eines der lautesten Flugzeugtypen und mit der DC-9- Super 80 eines der damals lärmärmsten Flugzeuge parallel einsetzte.

Austral plante wie erwähnt den Aufbau einer Flotte von fünf MD-81, nahm aber vorerst nur drei MD-81 ab (N10022, N10027 & N1003G), ermöglichten aber Austral einen erheblichen Wachstumsschub und Einrichtung neuer Streckenpaare sowie Kapazitätserweiterungen auf vorhandenen Routen. Die drei MD-80 waren in der ersten Hälfte der 1980er das modernste Fluggerät in ihrer Kategorie innerhalb Argentiniens. Im Zeitraum 1985 bis 1987 erwarben die Holding "Cielos del Sur" die Mehrheit an Austral. Die politischen und wirtschaftlichen Umstände in Argentinien hatten seit jeher auch Einfluss auf argentinische Fluggesellschaften. Zunehmend erschwerten diverse Faktoren einen wirtschaftlichen Flugbetrieb. 

Eine MD-81 (N1003G) stürzte am 12.06.1988 im Landeanflug in der Nähe des Flughafens von Posadas ab. Alle 22 Insassen starben.  Das Flugzeug kam als Flug AU046 aus Resistencia.

Erst im Jahr 1989 führte Austral zwei weitere MD-80 ein; es handelte sich hierbei um die MD-83 (N509MD & N907MD). 1991 bestellte Austral eine weitere MD-83 und vier MD-88. Die zusätzliche MD-83 versah mehrfach und über einen längeren Zeitraum ihren aktiven Liniendienst bei Aerolineas Argentinas, während die MD-88 von Anfang bei Aerolineas Argentinas zum Einsatz kamen, diese Lieferung somit transferiert wurde. 

Austral ersetzte ab Mitte der 1990er Jahre ihre BAC One-Eleven durch Douglas DC-9-30, die aus Beständen der Delta Air Lines und Iberia stammten. Die Standardisierung auf DC-9/MD-80 sollte aber nur von kurzfristiger Dauer sein, da man Ende der 1990er die Entscheidung fällte, Boeing 737-200Adv. als Ersatz der DC-9-30 einzusetzen. Neun Boeing 737 wurden dann in Ergänzung zur MD-80 eingesetzt.

In den Anfangsjahren mit Y155 Sitzplätzen ausgestattet, wurden die MD-81/-82 später mit 153 Sitzplätzen (C8Y145) eingesetzt. Mitte der 1990er Jahre erwarben Iberia (durch Mithilfe von Cielos del Sur?) die Mehrheit an Aerolineas Argentinas/Austral und diese neuen Besitzverhältnisse hatten auch Auswirkung auf das Farbschema von Austral, welches dem der Iberia angepasst wurde. Es darf angemerkt werden, dass die farbliche Anpassung von Austral und Aerolineas Argentinas an das Farbschema Iberia in Argentinien nicht ohne negative Kritik kommentiert wurde, da dadurch der "ausländische Einfluss deutlich wurde".

Die finanziellen Probleme bei Iberia Mitte der 1990er und damit verbundene Auflagen zum Erhalt von finanziellen, staatlichen Subventionen führten dazu, daß sich Iberia von Aerolineas Argentinas/Austral wieder trennte. Das Farbschema wurde abermals geändert und ein neues Erscheinungsbild vorgestellt, welches identisch mit dem Farbschema der Aerolineas Argentinas war. Mittlerweile wies noch der Schriftzug „Austral“ auf der rechten Rumpfseite offiziell darauf hin, daß es Austral noch gibt, während auf der linken Rumpfseite nur noch "Aerolineas Argentinas" zu lesen war. Es scheint so zu sein, daß der gesamte Flugbetrieb und alle Flugzeuge faktisch der Aerolineas Argentinas unterlag bzw. der Flugbetrieb der Austral dem der Aerolineas Argentinas nahtlos angeschlossen war. 

Im Zeitraum 2005/06 entschieden sich die Mehrheitseigner von Aerolineas Argentinas/Austral, den Flugbetrieb zu straffen und effizienter zu gestalten. Dies führte dazu, daß in Zukunft der Flugbetrieb sämtlicher MD-80 der Austral unterstellt werden, während Aerolineas Argentinas sich für den Betrieb der Boeing 737-200/-500 verantwortlich zeigen sollte. Die Transferierung der Boeing 737-200Adv.-Flotte von Austral zur 737-Flotte von Aerolineas Argentinas erfolgte im Zeitraum 2006/07 und am 31. August 2007 wurde die letzte Boeing 737 der Austral an Aerolineas abgegeben.  

Die MD-80 spielten bei Austral/Aerolineas Argentinas somit und fortan die einzige tragende Rolle im Kurz- und Mittelstreckenverkehr und zwischen 2005 und 2009 sollte die Flotte schubweise weitere Zuwächse erfahren. Diese Erweiterungen ergaben sich durch den notwendigen Ersatz von Boeing 737-200Adv., aber auch neuen Zuständigkeitsbreichen für Austral bzw. Streckenübertragungen seitens der Aerolineas Argentinas.  Weitere MD-83 aus Beständen der Flying Finn und Jetsgo sollten ab Ende 2005 die Flotte ergänzen, aber auch drei MD-88, die von Aerolineas an Austral transferiert wurden.  Bis Ende 2006 die Flotte auf  zwei MD-81, elf MD-83 und drei MD-88 - also 16 Exemplare ausgebaut. Zwei weitere MD-88 der Aerolineas Argentinas schienen derweil bei AirPlus Comet im Einsatz zu stehen. Eine erste MD-81 wurde unterdessen von Austral aus dem Flugbetrieb gezogen. Konträr zu den Angaben für Ende 2006 wird im April 2007 die Flottenstärke mit zwei MD-81, einer MD-82, neun MD-83 und drei MD-88 angegeben.

Anfang Mai 2007 tauchen Grafiken auf, die ein neues Farbschema zeigen. Die Gründe der visuellen Abgrenzung von Aerolineas Argentinas sind (mir) nicht bekannt. Es besteht aber die Möglichkeit, dass eine "stärkere Abgrenzung" zur Aerolineas Argentinas gewünscht war.

Es gibt Mitte September 2007 Meldungen, dass Austral die Einführung von weiteren vier MD-80 vorbereitet. Dabei soll es sich u.a. um mindestens ein Exemplar handeln, welches sich aktuell noch bei AeroRepública im Einsatz befindet und einst an Finnair ausgeliefert wurde. Zwei MD-83 sollten aus Beständen der Alaska Airlines kommen.

Es gibt Mitte September 2007 dann aber auch die in sich widersprüchliche Meldung, dass Austral alle MD-88 (fünf Exemplare) und eine MD-83 an Aerolineas Argentinas zurückgeben wird und dies mit der schwer verständlichen Begründung, dass die Marsans-Gruppe (Besitzer von Aerolineas Argentinas) den Ersatz der MD-80 beschleunigen würde. Gerüchte meinen, dass Aerolineas Argentinas die zurückgegebenen sechs MD-80 durch "drei (Airbus) A320 und drei MD-80 oder durch sechs A320" ersetzen könnte. In der Tat sehr rätselhafte Gerüchte, die sich intern widersprechen. Eine Klärung des Sachverhalts wird es hoffentlich bald geben. Eine erste A320 wurde dann tatsächlich in den Farben von Aerolineas Argentinas gesichtet und auch ausgeliefert.

Die Grupo Marsan (Besitzer von Air Comet und Aerolineas Argentinas) hat eine Absichtserklärung für den Kauf von 73 Flugzeugen des Herstellers Airbus unterzeichnet, darunter höchst wahrscheinlich 42 Airbus A320, die bei Air Comet und Aerolineas Argentinas möglicherweise den Ersatz bestehender Flotten für die Kurz- und Mittelstrecke einleiten könnten. Aerolineas Argentinas setzt zwar nach offizieller Darstellung keine MD-80 mehr ein (Austral zeigt sich hierfür verantwortlich und baute wie erwähnt ihren Betrieb mit MD-80 sogar weiterhin aus); dennoch darf man annehmen, dass die A320-Bestellung Auswirkungen auf die mögliche verbleibende, zukünftige Rolle von fünf MD-88 und einer MD-83 der Aerolineas Argentinas haben könnte, die aktuell noch von Austral betrieben, aber verschiedenen Meldungen nach an Aerolineas Argentinas wieder retourniert werden sollen. 

Im Zeitraum 2008/09 wurde die Erweiterung der MD-80 durch Einführung von zusätzlichen MD-80 forciert. Gleichzeitig wurde die MD-81-Flotte von zwei auf ein Exemplar reduziert. Es wird erwartet, dass die letzte MD-81 in baldiger Zukunft ebenfalls ausgemustert und dann verschrottet wird. Das während ihrer Lebenszeit absolvierte Pensum an Flügen ist erstaunlich. Die Flottenstärke wird im Frühjahr 2009 mit einer MD-81, zwölf MD-83 und neun MD-88 angegeben. Die zusätzlichen MD-88 stammen aus Beständen der AeroMexico. Obwohl auf dem ersten Blick der Ausbau einen positiven Ersteindruck erwecken, so existieren ausreichend Meldungen über immer wiederkehrende Streikaktivitäten und Mangel an Ersatzteilen bzw. in der technischen Betreuung der Flugzeuge, die in nicht flugtüchtigen Flugzeugen resultieren und zu einer somit nicht zu 100% einsatzbereiten Flotte. Zeitweise sollen bis zu sechs (?) MD-80 abgestellt worden sein, da schlicht die Wartung nicht so erfolgen konnte, wie geplant. Gleichzeitig zeigen sich Austral für einen großen Anteil des Linienbetriebs innerhalb Argentiniens verantwortlich.

Am 21. Juli 2008 entschied die argentinische Regierung eine (Wieder-)Verstaatlichung der Fluggesellschaften Aerolineas Argentinas und Austral durch die Übernahme von 99,4% der Anteile an AR/AU zu einem nicht genannten Kaufpreis. Die verbliebenen 0,6% werden weiterhin von Mitarbeitern der Fluggesellschaften gehalten. Am 03. September 2008 stimmte der Senat der Nationalisierung mehrheitlich zu.

Während die Entscheidung seitens der Aerolineas Argentinas zugunsten für zwölf Boeing 737-700 sehr wahrscheinlich keine unmittelbaren Auswirkungen auf die MD-80-Flotte bei Austral haben werden, so entschieden sich Aerolineas Argentinas im März 2009 für die Einführung von 20 Embraer 190. Inwieweit diese Entscheidung Auswirkungen auf die mittelfristige Zukunft der MD-80-Flotte bei Austral haben wird, blieb abzuwarten. Sehr schnell wurde aber deutlich, dass Austral mittelfristig eine Standardisierung auf die Embraer 190 umsetzen wollten.