Angkor Airways wurden im Jahr 2004 gegründet und soll eigenen Angaben nach am 30.08.2006 ihren Linienflugbetrieb mit einer MD-83 aufgenommen haben. Operationelle Basis war Phnom Penh und es wurden u.a. Chengdu, Kaohsiung, Taipei sowie Siem Reap als Destinationen angeboten. Die MD-80 wurde von FAT Far Eastern Air Transport zur Verfügung gestellt und es ist auch wahrscheinlich, dass FAT technisch wie operationell assistierend wirkte. Später stellte sich heraus, dass Angkor Airways eine von diversen Investitionen seitens der FAT darstellte. Eine zweite ebenfalls von FAT zur Verfügung gestellte MD-83 sollte den noch jungen Flugbetrieb beim Aufbau verhelfen, wobei aber mehrheitlich die Information existiert, dass Angkor Airways insgesamt jeweils eine MD-83 und eine Boeing 757 von FAT angemietet hatten.
Ende März 2007 gab es aber Meldungen, dass Angkor Airways "zwei Boeing 737-300/-400 für fünf Jahre ab September 2007" anmieten möchte. Dies wurde unbestätigt als ein Indiz gesehen, dass man mittelfristig von den angemieteten McDonnell Douglas MD-80 auf die 737 umsteigen wollte...
Aufgrund des Zusammenbruchs der taiwanesischen FAT Far Eastern Air Transport stellten Angkor Airways am 09.05.2008 ihren Flugbetrieb ebenfalls ein.